中丹学院坚持“科教融合”的办学模式，融合中科院科研实力较强的研究所的教育科研资源。
现在，学院拥有一支科教融合的高水平师资队伍，已备案的研究生导师555名，其中博士生导师407名，硕士生导师148名。
中丹学院下设8个硕士项目，分别为水与环境、化学与生物化学工程、公共管理、创新管理、纳米科学与技术、生命科学工程与信息学、神经科学与神经影像、食品与健康。中丹学院涵盖的一级学科包括生物学、心理学、材料科学与工程、动力工程及工程热物理、化学工程与技术、环境科学与工程、地理学、生态学、物理学、化学、公共管理、管理科学与工程。（数据截至2021年4月）
